Когато човечеството навлезе в тази нова ера, обезумели мутанти, известни като "Другите", започнаха да се спускат от небето с жажда за човешки мозъци. Особено устойчиви на конвенционални методи на атака, бяха необходими крайни мерки за борба с преобладаващата заплаха и запазване на човечеството. Тези с екстрасензорни способности, известни като Псионици, бяха шансът да се отблъсне атаката отгоре. До ден днешен, Псиониците са били разузнавани за техните таланти и набирани в Силите за потискане на Другите (OSF), последната линия на защита на човечеството.
Поемете ролята на Юито Сумераги, новобранец в OSF, който се стреми да стане топ псионик като този, който го спаси като дете. Въоръжен с таланта на телекенеза, изследвайте футуристичния град Ню Химука и разкрийте мистериите на бъдещето на Brain Punk, затворено между технологията и психическите способности в SCARLET NEXUS.